El Museu Arqueològic és la institució que conserva, investiga i exhibeix les restes materials del passat històric de les illes d'Eivissa i Formentera. Es troba dividit en dos seus, ambdues emplaçades a la ciutat d'Eivissa. D’una banda, el Museu Arqueològic d'Eivissa i Formentera, el contingut museogràfic del qual compren tres mil anys d'història de les Pitiüses —des dels primers pobladors fins a la conquesta catalana de 1235—, es troba situat en un lloc emblemàtic dins de la ciutat emmurallada de Dalt Vila, a la zona més elevada coneguda com a Plaça de la Catedral. Al seu voltant trobam tot un seguit d’edificis històrics, com el Castell, el Palau Episcopal, la Casa de la Cúria, l'antiga Llotja, avui convertida en mirador (des d'on es poden apreciar unes increïbles vistes del barri de la Marina, el port i el modern eixample de la ciutat), i l'església de Santa Maria, constituïda en catedral el 1785.
D’altra banda, el Museu Monogràfic del Puig des Molins està situat en el jaciment arqueològic de la Necròpolis del Puig des Molins i és un gran centre interpretatiu del mateix, alhora que punt de recepció i acollida de visitants. En el Museu Monogràfic del Puig des Molins, el visitant podrà conèixer tant la història del jaciment com els materials arqueològics més importants que la necròpolis ha proporcionat, degudament explicats i contextualitzats.